一般情况下，芥菜根部是可以生吃的，但可能会影响口感。
芥菜是一种比较常见的野菜，其中含有丰富的胡萝卜素、维生素C、氨基酸、钙、铁等，适当食用可以补充身体所需要的营养物质。其中含有的钙元素还可以促进钙的吸收，能够增强自身免疫力。而且芥菜根部中的营养也比较丰富，其中含有丰富的纤维素、膳食纤维等，适当食用能够促进胃肠道蠕动，从而起到通肠润便的作用。但是芥菜根吃起来可能会比较苦，此时可以通过做菜汤、凉拌等方式食用，经过添加调味品，味道一般是比较鲜美的。
虽然芥菜根部的营养比较多，但并不适合所有人群食用，尤其是对芥菜过敏的人群，食用后可能会出现皮肤红肿、皮疹等过敏反应，严重时，还可能会出现过敏性休克的情况。另外，婴幼儿也不建议食用，因为年龄较小，胃肠道功能发育不完善，食用后可能会引起消化不良。