衣原体感染可引起多种疾病，如果不及时治疗，可能会导致肺炎、沙眼、不孕不育等疾病。
1、肺炎
肺炎衣原体是人类呼吸道疾病的重要病原体，感染的临床表现轻重不一，若不及时治疗可能从无症状发展为重症肺炎，伴有发热、咳嗽等不适症状。
2、沙眼
沙眼是沙眼衣原体感染后的常见病之一，好发于儿童阶段，主要经直接或间接接触传播，导致眼部发红、发痒、分泌物增多。若不及时治疗可能会导致角膜溃疡、上睑下垂等并发症。
3、不孕不育
衣原体感染是导致女性不孕不育的常见原因之一，感染后不及时治疗可能会导致输卵管炎、卵巢炎等，对输卵管的正常生理结构造成影响，从而影响卵子的正常受精和着床。此外，衣原体感染也可能会导致男性生殖系统的感染，如睾丸炎、前列腺炎等，影响精子的质量和数量，从而导致不育。
除上述外，衣原体感染后不治疗还可能会导致尿道炎、性病淋巴肉芽肿等疾病。衣原体感染需要及时治疗，以避免对身体造成严重的影响。如果出现衣原体感染的症状，如尿道分泌物、尿频、尿急等，应及时就医进行检查和治疗。