孕早期12周内，子宫还在盆腔内，所以如果有肾的位置偶尔疼，多不考虑与妊娠有关，不排除是肾结石或者腰部肌肉骨骼疾病等原因导致的，需要在明确病因后接受对症有效的治疗。
如果孕妇体内的代谢异常，可能会导致草酸盐沉积，出现肾结石的情况，导致肾区部位疼痛、排尿异常等不适的症状。建议孕妇多喝温热的水加速体液的排泄，同时也需要多吃一些新鲜的瓜果蔬菜，都有助于改善肾结石的症状。
腰痛是孕妇常见症状，可以通过局部热改善。躺下及起床时采取侧身位，可以减少疼痛。
除了上述比较常见的原因外，还有可能是肾盂肾炎、肾脓肿等多种原因引起的。日常生活中，建议孕妇多观察身体变化情况，如果出现严重不适症状时，建议及时就医治疗，以免延误病情。