产后39天有褐色分泌物可能是恶露未排干净、宫腔内胎盘残留、子宫复旧不全、宫颈炎、子宫内膜炎等原因导致。
1、恶露未排干净
一般产后28天血性恶露排除干净，恶露变为黄色或白色。如果患者在产后休息不够或者出现感染，导致蜕膜不能完全排出，长时间停留在子宫当中，从而出现有褐色分泌物的现象。建议患者口服益母草，注意休息，42天仍有褐色分泌物，需到医院复查。
2、宫腔内胎盘残留
如果产后胎盘胎膜未完全排出，出现胎盘残留的现象，产后褐色分泌物会持续较长时间，甚至超过42天。患者应及时就诊，可遵医嘱服用新生化颗粒、益母草颗粒等治疗，必要时进行清宫手术。
3、子宫复旧不全
如果女性在生产后身体恢复不佳，可能会导致子宫复旧不良，从而出现上述症状。建议女性遵医嘱使用缩宫素注射液、益母草颗粒等药物进行治疗。
4、宫颈炎
宫颈炎是指子宫颈发生的炎症反应，可能与病原体感染有关。患者会出现阴道分泌物增多、阴道异常出血等症状。建议患者遵医嘱使用阿奇霉素片、盐酸多西环素片等药物进行治疗。
5、子宫内膜炎
如果患者产后出现细菌突破宫颈的防御侵入子宫内膜而发生炎症，引起子宫内膜炎。患者可能会出现下腹痛、阴道分泌物异常、异常阴道出血等症状。建议患者可以在医生的指导下使用阿莫西林胶囊、注射用头孢曲松钠等药物进行治疗，日常还要注意休息，避免过度劳累。
建议患者及时到正规医院就医，查明病因后再遵医嘱采取相应的治疗措施。