奥硝唑与甲硝唑均属于抗菌药物。但在作用机制、适用范围以及不良反应方面存在差别。因此不建议将奥硝唑与甲硝唑同类药物代替，而是分开服用或者分次服用。
1、作用机制不同
奥硝唑为硝基咪唑类衍生物，可通过抑制阿米巴原虫的氧化还原反应，使氮链发生断裂。而甲硝唑是硝基咪唑类衍生物，也属于抗菌药物，可作用于厌氧菌等微生物。
2、适用范围不同
奥硝唑主要用于治疗由敏感病原体所致的感染性疾病，如腹部术后感染、妇科炎症、败血症、伤口感染等，还可以预防厌氧菌引起的脓肿、蜂窝组织炎等。而甲硝唑常用剂型有片剂、胶囊剂、栓剂等，可用于治疗肠道和肠外感染、阴道滴虫病、皮肤利什曼病、麦地那龙线虫感染等。
3、不良反应不同
奥硝唑较甲硝唑不良反应轻微，多呈一过性。而甲硝唑的常见不良反应为消化道症状，包括恶心、呕吐、食欲不振、腹泻等，神经系统症状包括头痛、眩晕、感觉异常、肢体麻木等，大剂量使用时偶见癫痫发作、精神错乱、共济失调、颅内压增高等情况。上述两种药物中的任意一种出现不良反应时，建议患者立即停止使用并就医处理。
4、其他区别
奥硝唑与甲硝唑都可能引起白细胞减少、中枢神经系统紊乱等不良反应，但甲硝唑相对甲硝唑不良反应更严重，且发生率更高。
综上所述，如果需要使用奥硝唑或甲硝唑，建议先到医院就诊。经医生判断病情后，根据具体情况选择合适的药物进行治疗，避免自行用药，以免出现不良反应。