怀孕三个月总打嗝往上反气，多考虑是激素水平发生变化引起的，也不排除与饮食不当、消化不良等原因有关。可以根据具体的原因进行针对性的处理。
1、激素水平发生变化
女性怀孕以后，体内孕激素水平会出现升高的情况，此时受到体内激素影响，可能会导致胃肠道蠕动减慢，胃酸积聚，从而对胃肠道造成刺激，出现打嗝反酸的症状。这属于一种正常的生理反应，一般并不需要特殊治疗。可以适当调整个人饮食习惯，注意少食多餐。同时也要注意腹部保暖，避免受凉。餐后不要躺下，要坐起，散散步，可以避免反酸。
2、饮食不当
女性在怀孕期间，经常食用过多容易产气的食物，如红薯、萝卜等，可能也会对胃肠道造成刺激，出现嗳气、打嗝等不良反应。日常生活中可以适当调整个人饮食习惯，注意饮食清淡，避免食用过多容易产气的食物。同时也要注意少食多餐，避免暴饮暴食。
3、消化不良
随着怀孕时间的增长，胎儿会逐渐增大，子宫增大，可把胃顶成横向，加上蠕动减慢，如果一次性进食过多，可能会影响到个人的消化功能，出现消化不良，伴随打嗝反酸的症状。可以用手顺时针按摩腹部，促进胃肠蠕动缓解症状。严重时也可以在医生的指导下服用健胃消食片、乳酸菌素片等药物进行调理。
除此之外，也不排除与慢性胃炎、胃溃疡等疾病因素有关。如果通过上述方法无法得到改善，需要及时就医治疗。