早上唾液发黑褐色可能与饮食因素、药物因素、口腔疾病等有关，需要根据具体的病因采取相应的治疗措施。
1、饮食因素
如果在前一天晚上吃了黑色素含量较多的食物，如黑芝麻、黑米等，可能就会导致口中出现黑褐色物质沉积，从而在早上出现唾液发黑褐色的情况。这种情况下一般不需要进行特殊的处理，停止吃以上食物后就可以自行恢复。
2、药物因素
如果患者长期使用抗生素类、铁剂等药物，如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒、硫酸亚铁片等，由于药物中含有金属离子，在唾液酶的作用下可导致口服药物后唾液颜色发生改变。若没有出现其它不适，则不需停药。如果出现其它不适的症状，则建议及时告知医生，遵医嘱停止使用该类药物。
3、口腔疾病
若患有牙龈炎、牙周炎等疾病，由于细菌感染，导致局部组织受损，从而引起出血，血液长时间淤积在唾液中，经过一晚上氧化可变为黑褐色，从而出现上述情况。此时建议遵医嘱应用甲硝唑片、替硝唑片等药物进行治疗，同时要注意保持口腔的卫生清洁。
此外，胃溃疡、十二指肠溃疡等消化道疾病也可能会出现上述症状。建议平时养成良好的生活和饮食习惯，规律作息，避免熬夜，合理膳食，多吃新鲜水果和蔬菜。