新生儿百日咳具体要住院多久，还需要根据病情的严重程度进行分析。
新生儿百日咳考虑跟百日咳杆菌感染有关，通常会出现阵发性痉挛性咳嗽，咳嗽持续的时间可能会相对较长，如果得不到及时有效的治疗，会给呼吸道带来严重的损伤。如果新生儿体质比较好，免疫力相对较强，可能需要住院一周左右。如果本身体质相对较低，免疫力也比较低，可能需要住院两周左右，从而使疾病得到缓解。
新生儿患有百日咳，可以在医生的指导下合理使用阿奇霉素颗粒、克拉霉素胶囊等药物进行治疗，能够抑制炎症反应；也需要在早期注射百日咳疫苗，能够有效的预防该疾病。同时需要注意一日三餐的饮食规律，母乳喂养时，母亲的饮食应以清淡的、容易消化的食物为主，比如小米粥、蔬菜汤等，减少食盐的摄入量。同时需要时刻注意新生儿身体的变化，如果出现了明显的不适症状，应及时就诊。