一般情况下，生牡蛎临床上具有潜阳补阴的功效，因此生牡蛎属于补阴的食物。
生牡蛎是一种常见的中药，同时也用作食物，味咸、性微寒，归肝胆肾三经。生牡蛎具有重镇降逆、安定心神、下降上逆的肝阳、补阴以及软坚散结的功效。临床上用于惊悸失眠、瘰疬、痰核、眩晕耳鸣等病症的治疗。生牡蛎能益阴潜阳，还适用于肝肾阴虚，肝阳上亢之头晕目眩、耳鸣耳胀、烦躁易怒等症状。临床常与龙骨、柏子仁合用，可治阴虚阳亢诸证；与鳖甲、阿胶合用，治热病阴伤，虚风内动；与黄芪、麻黄根合用，用于自汗、遗精、盗汗、气短等症状。
但需注意的是对于脾胃虚寒的患者不宜久服或大量用药，以免增加脾胃的负担。此外，凡便秘者也要忌用，阳虚寒盛、肾阳亏虚者不宜使用。如需用药，建议在中医师的辨证指导下使用，擅自用药可能造成不良的后果。