通常情况下，三岁小孩身高发育迟缓怎么办需要根据具体病因判断，其可能是营养不良、睡眠不足、缺乏锻炼、甲状腺功能减退、生长激素缺乏等因素导致。
1、营养不良
三岁小孩长期挑食、偏食，或者是吃太多的零食，都有可能导致身体中的蛋白质和热量摄入不足，从而导致营养不良。患者表现为体重下降、身材矮小、语言表达能力弱和生活自理能力差等。此时家长要对小孩的饮食进行适当地调整，做到荤素搭配，多补充营养。患者也可以在医生指导下适当地补充微量元素，如维生素D3、葡萄糖酸钙口服溶液等药物调理。
2、睡眠不足
如果小孩没有养成良好的作息习惯，长时间熬夜，可能会使体内激素分泌发生紊乱，从而出现身高发育迟缓的现象。小孩应保持充足的睡眠，避免熬夜。
3、缺乏锻炼
如果小孩平时缺乏锻炼，可能会影响到自身的新陈代谢，也会影响到骨骼的正常发育，从而出现上述情况。小孩可以适当进行体育锻炼，比如打篮球、踢足球等。
4、甲状腺功能减退
三岁小孩如果患有甲状腺功能减退，一般会有特别的面部特征，如头大、颈短、眼距宽、鼻梁低等，还会有发育迟缓的症状，如身材矮小、四肢短小、智力低下等。此时患者应及时到医院检查并针对治疗，如果诊断正确，患者需要遵医嘱服用甲状腺片、左甲状腺素钠片等药物治疗。
5、生长激素缺乏症
三岁小孩生长激素缺乏症，主要是因为小孩的垂体发育不良，或者是下丘脑肿瘤或者是颅内感染，都会对体内的生长激素合成和分泌产生影响。通常情况下，小孩的身高会比同龄人要低，而且生长速度会比较慢。如果出现这种情况，患者应遵医嘱使用注射用重组人生长激素、注射用人生长激素等药物治疗。同时患者可以多吃富含雄激素的食物，比如牡蛎、鸡蛋、海带、鲜虾等。
除了上述的原因之外，也有可能与遗传基因、缺钙、矮小症等有关。在日常生活中，家长要注意给小孩增加营养，确保每天的饮食平衡，多吃鱼肉、猪骨汤、牛奶、豆制品等，这样才能刺激食欲。小孩还要注意培养良好的生活习惯，多做运动，提高身体素质。