吞咽时舌头根疼痛多考虑饮水过少引起的，也可能是上火、乳蛾等导致的，治疗应基于病因。
1、饮水过少
如果在日常生活中饮水量比较少，不能满足身体的需求，在一定程度上会使咽部受到刺激，从而出现发干、疼痛等症状。可以通过多喝水的方式进行改善，也可以多吃一些水分含量比较高的水果，比如西瓜、梨等。患者应该及时补充身体水分，使咽喉部位的黏膜得到充分浸润，进而有效缓解不适症状。
2、上火
人体阴阳失衡，内火旺盛，即会上火。当患者不注意合理膳食，大量吃辣椒、火锅等辛辣刺激性的食物，可能会导致身体阴虚火旺。通常会表现为咽喉肿痛、口舌生疮等症状。患者可在医生的指导下，使用牛黄解毒片、牛黄清胃丸等药物进行治疗，药物治疗的同时也需要多喝水。
3、乳蛾
当身体外感风寒后没有及时得到有效治疗，可能会使脏腑受损导致虚火上炎，从而出现咽干不适、喉核红肿等症状。患者可遵医嘱使用蒲地蓝消炎口服液、维C银翘片等药物进行治疗。还需要做好口腔护理工作，饭后用温水漱口。
除此之外，上述症状还可能是咽炎、梅核气,等疾病引起的。患者用药期间严格遵医嘱，不要擅自增减药量。如果症状持续时间较长且得不到改善，需要及时就医。