炮附子与制附子临床上其区别主要在于炮制方法不同。炮附子与制附子是同一种植物，两者在功效上并没有明显区别。
炮附子与制附子，都是附子炮制后得到的中药材，炮附子通常用土煨烤而成，而制附子主要经盐渍、水漂、煮、炒等方法炮制。炮附子与制附子药性辛、甘、大热，归心、肾、脾经，都具有补火助阳、散寒除湿等作用。都可用于治疗因寒邪侵犯脾胃导致的胃腹疼痛、泄泻，还可用于治疗阳痿、宫冷、阴寒水肿等症状。
因附子有毒，孕妇服用后可能会影响胎儿的发育，因此孕妇应谨慎服用制附子和炮附子。本品不可与半夏、瓜蒌、贝母、白及、白蔹、天花粉等药物同用。建议患者在专业中医师的辨证指导下服用制附子和炮附子，避免盲目自行用药，以免治疗无效，或出现严重不良影响。另外药物治疗期间需要保持清淡健康饮食，要避免吃生冷辛辣油腻性的食物，可能会影响到药性的发挥，不利于自身的病情调理和治疗。