临床上藁本具有祛风散寒、除湿止痛等功效与作用，主治风寒感冒和风湿痹痛等病症。
藁本药性辛、苦、温，归膀胱经。可以祛风散寒，可用于治疗风寒表证，主要因为外感风寒导致的恶寒、鼻塞、流涕、打喷嚏、身痛、巅顶疼痛等症状。在中医辨证的基础上，对于风寒感冒，巅顶疼痛的患者，可以与羌活、苍术、川芎等配伍使用。藁本还可能除湿止痛，可用于治疗风湿痹痛，主要因为寒湿导致的关节、肌肤出现的冷痛、沉重等症状。临床可以与羌活、防风、威灵仙等祛风湿药合用，可以达到更好的临床效果。
如需用药应在医生指导下进行，切勿擅自服药。服药期间，要注意清淡饮食，不能吃生冷、辛辣等刺激性食物。本品辛温香燥，血虚头痛忌服，凡阴血亏虚、肝阳上亢、火热内盛之头痛者忌服。对于久病体虚、自汗、盗汗的患者，虽有表证，但也要慎用此类药物。用药后，注意观察有无不良反应，若出现过敏反应，立即停药，及时就医。