脚趾甲凹凸不平像波浪的治疗方法是因人而异的，需要在医生的指导下进行相关检查确定病因后，使用药物进行治疗。通常引起上述症状的原因可能是甲损伤、营养不良和甲癣等因素导致。
1、甲损伤
因为外伤等因素可能会造成脚趾甲床损伤，出现这种现象，同时也可能会出现甲下淤血的情况。一般情况下，可以等脚趾甲长出来后，剪去多余的脚趾甲即可，通常不需要特殊治疗。患者也应注意避免再次损伤局部。
2、营养不良
维生素B和维生素D缺乏严重可能会影响到脚趾甲的生长发育，造成脚趾甲表面不平整的现象。患者可在医生的指导下服用维生素B片和维生素D片等缓解。患者平时也应注意饮食多样化，避免挑食。
3、甲癣
这一般是由酵母菌、非皮肤癣菌性丝状真菌、皮肤癣菌等引起的，可能会出现上述情况。患者可在医生的指导下使用环吡酮胺乳膏和阿莫罗芬乳膏等药物进行治疗。患者也应保持局部的卫生清洁。
除上述因素外还有可能是真菌感染等因素引起。建议患者在日常饮食中加强营养饮食，多吃富含钙质以及微量元素的食物。生活中适当外出晒太阳，促进钙质吸收。