男性杂菌感染一般是指生殖器部位同时出现多种类型的细菌感染，可以通过改善生活方式、全身用药、手术方式进行治疗。
1、改善生活方式
建议患者平时需要经常清洗尿道，保持尿道的清洁卫生，还应勤换内裤，避免同房，可以一定程度上有效地预防杂菌感染的反复发作，有助于病情的恢复。还可以多喝温开水，增加身体新陈代谢，以此促进排尿，使细菌通过尿液排出体外。
2、全身用药
男性杂菌感染，需要遵医嘱服用阿奇霉素片、盐酸多西环素片等药物进行抗菌抗感染治疗，清除杂菌。同时还可遵医嘱口服头孢拉定胶囊、头孢呋辛酯片等药物治疗。可以改善男性杂菌感染引起的尿道肿胀感与尿频尿急症状。
3、手术
若是由于男性包皮过长，而导致的机体受到杂菌感染时，可配合医生进行手术切除的治疗。术后需注意创口部位的保护，注意避免沾水，以免发生继发感染等更为严重的现象。
除以上外，建议患病期间避免辛辣刺激的食物，戒烟忌酒，保持生殖器官部位的干燥、清洁，选择宽松的内裤。严重者还需及时到医院进行就诊。