水陆二仙丹的功效是补肾益水、清热降火，具有治疗肾水不足，相火内动的功效。
水陆二仙丹由金樱子、芡实组成，具有补肾、滋阴、收敛吸收的功效。可以用于治疗有精液白浊的男性，阴道分泌物的女性，以及肾虚引起的尿频和遗尿等。方中金樱子能固精固尿，固血止血，收敛肠道，止泻。芡实可以益肾固精、补脾、止泻、除湿、止血，一药生于水，一药生于陆，故名水陆二仙丸。两药合用，具有补肾、滋阴、收敛吸收的功效。
服用水陆二仙丸前，有潮热、盗汗、五心热、阴虚内热等症状者，以及便秘、口干、咽干、口舌酸痛等症状者禁用。如果在用药期间出现上述症状恶化或其他新症状，应停止用药并及时就医。但在使用过程中应避免食用辛辣刺激性食物。服用时，应注意禁欲和清淡饮食。在使用水陆二仙丹之前，建议在专业医师的辨证指导下到正规医院进行治疗。在专业医生的指导下，按时适量服用水陆二仙丹。