三个月宝宝身高不达标应根据具体情况予以判断，可能是缺少阳光照射、睡眠不足、维生素D缺乏性佝偻病等原因导致的，大多可以通过一般治疗、药物治疗予以改善。
1、缺少阳光照射
阳光中的紫外线可以帮助机体内维生素D合成，如果三个月宝宝缺少阳光照射，可能会导致骨骼的生长受到影响，从而表现出身高不达标的情况。对此，建议在日常中适当进行阳光照射。
2、睡眠不足
三个月宝宝在睡眠时会分泌较多生长激素，若是睡眠不足，可能会使身高受到影响，出现不达标。针对这一情况，应在夜间营造良好的睡眠环境，帮助其入睡。
3、维生素D缺乏性佝偻病
维生素D缺乏性佝偻病是以维生素D缺乏导致钙、磷代谢紊乱和临床以骨骼的钙化障碍为主要特征的疾病。如果患有疾病，可能会表现出身高不达标的情况。建议遵医嘱使用骨康胶囊、维生素D滴剂、硫酸软骨素片等进行治疗。
除了上述相对常见原因，该情况还可能是甲状腺功能减退等造成的。若伴有明显的不适症状，应及时就诊，明确具体情况，并进行针对性治疗。