上颌窦囊肿会癌变的可能性很小，可及时配合医生进行手术治疗。
上颌窦囊肿是临床较为常见的一种上颌窦良性病变，大多是因为上颌窦黏膜腺管口异常堵塞，使粘液潴留于窦黏膜内所形成，属于良性肿瘤，且囊肿生长缓慢，早期无明显的不适症状，可发生癌变的可能性很小，极少数患者会有恶变的可能，因为上颌窦囊肿并不会导致细胞恶性增生。随着囊肿体积增大患者可出现鼻塞、流鼻涕、鼻窦反复炎症、面部压痛感、肿胀等症状，影响日常生活时应尽早配合医生进行手术治疗，比如单纯鼻内镜手术、鼻内镜联合上颌窦前壁开窗术、鼻内镜联合下鼻道开窗术等，通过手术的方式将上颌窦的囊肿物切除，从而达到改善症状和治疗疾病的效果。
部分患者在手术后会出现面部麻木、牙痛等症状，如果不伴有神经损伤，可在一段时间后自行消退，患者不必过于紧张。