木瓜生吃和煮熟的功效差别不大，具有一定的舒筋活络、化湿和胃等功效。木瓜味酸，性温，归肝、脾经。
1、生吃
中医认为，木瓜生吃可以舒筋活络、化湿和胃，其性温，味酸，入肝经和脾经。其可辅助用于治疗痹症，如关节疼痛、拘挛、肿胀，肢体酸重、麻木不适等。其也可辅助用于治疗中焦湿盛，如恶心、胃胀、呕吐、腹泻等。木瓜生吃的不良反应尚不明确，胃酸过多者不宜食用，内有郁热、小便短赤者忌服。木瓜一般入中药煎剂，作为食物食用时，也可起到一定的舒筋活络、化湿和胃的功效，但未经正确煎服以及配伍，一般起不到治疗效果。
2、煮熟
木瓜味酸入肝，煮熟食用善于舒筋活络，且能祛除湿痹，尤为湿痹筋脉拘挛之要药，亦用于腰关节酸痛的治疗。本品温通，祛湿除筋，善辅助治感受风湿，足癣肿痛不可忍者。本品温香入脾，能化湿和胃，善治湿阻中焦之吐泻转筋。药物禁忌、不良反应暂不明确。
木瓜无论生吃还是煮熟食用药用功效有限，不能代替药物治疗疾病，不要盲目用药，建议在中医师辨证指导下遵医嘱用药，以免延误病情。