一般没有匹多莫德和转移因子哪个效果好这一说法。两者都是免疫增强剂，具体效果应根据患者对药物的吸收情况和敏感程度来判断。
匹多莫德主要用于细胞免疫功能受抑制患者，也可用于反复上呼吸道感染、下呼吸道感染、中耳炎、泌尿系统感染、妇科感染患者。主要适用于细胞免疫功能较弱的患者。匹多莫德的不良反应包括偶尔恶心、呕吐、腹泻、皮疹等。另外高敏感人群和妊娠三个月内的女性应慎用。
转移因子是一种细胞免疫促进剂，主要用于病毒或真菌感染，如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念珠菌感染、病毒性心肌炎等。转移因子也可用于恶性肿瘤的辅助治疗，如肺癌、鼻咽癌、乳腺癌、骨肉瘤等。对免疫缺陷性疾病也有很好的疗效，如湿疹、血小板减少症、多重感染综合征、慢性皮肤真菌病等。
患者用药时建议谨遵医嘱，避免擅自服药。若有不适症状，应及时去医院就医，诊断具体病情后在医生指导下进行规范用药。