硫酸头孢喹肟为兽用药，主要用于敏感菌引起的猪、牛的呼吸系统感染、乳房链球菌和大肠杆菌引起的泌乳期奶牛的乳房炎等病症。
硫酸头孢喹肟是唯一一个动物专用第四代头孢类抗生素，其状态为混悬油类溶液，液体中包含一些细微颗粒，摇匀后会呈现均匀的白色或浅褐色的混悬液。硫酸头孢喹肟具有抗菌谱广、抗菌活性强的特点，适用于非肠道用药，生物利用度较高并且毒性较低。主要应用于敏感菌引起的猪、牛的呼吸系统感染及奶牛乳房炎及猪的无乳综合征的临床治疗。临床研究表明，硫酸头孢喹肟用于肌内注射、皮下注射时吸收迅速，生物利用度较高。在使用前需将药液摇匀。
由于硫酸头孢喹肟主要为兽用，对人体的安全性尚不明确，不可擅自用于治疗人类疾病。另外，如果自身为青霉素过敏者，禁止接触硫酸头孢喹肟，以免产生过敏反应。