体温35.5度伴有头疼多考虑是生理性因素引起的，也不排除是细菌感染和病毒性感冒等引起的，需要查明病因对症治疗。
1、生理性因素
如果长期处于低温寒冷的环境或情绪不稳定等可能会使得中枢体温调节功能异常，大脑供血不足，引起缺氧，有可能出现上述情况，并且伴随寒颤、发抖、手脚冰凉等症状，而且如果饮用过多的浓茶、咖啡、酒等刺激性饮品刺激大脑皮层，使中枢神经兴奋，也可能会出现上述情况。这是正常现象，不需要采取特殊处理。一般可以通过保暖，控制情绪，多喝水等方式慢慢恢复正常。
2、细菌感染
如果身体受到细菌感染，可能会出现上述情况，也可能出现发热，乏力，头晕等不适症状。遵医嘱使用头孢克肟片、青霉素V钾片、盐酸左氧氟沙星胶囊等抗生素类药物杀菌消炎，还可以通过冰敷，酒精擦拭等物理方法降温。
3、病毒性感冒
如果身体着凉，或者吸烟酗酒、过度劳累、被病毒入侵等都可能会出现以上情况并且伴随鼻塞，流涕，咽痛等症状，可以遵医嘱服用感冒清热颗粒、风寒感冒颗粒，还可以通过泡脚，洗热水澡和喝红糖生姜水等驱寒。
另外，还可能与甲状腺功能减退等有关，要及时去正规医院治疗，以免延误病情。