12岁女孩来月经一直不干净大多考虑是卵巢功能发育不成熟、内分泌紊乱导致，也有可能是子宫功能性出血等原因所导致，病因不同，治疗方式不同。
1、卵巢功能发育不成熟
12岁女孩月经在初潮阶段，卵巢功能发育尚不成熟，没有固定的月经周期，偶尔可能会出现月经持续较长的情况，属于正常现象。随着年龄的增长身体各个器官逐渐发育成熟，此现象也会逐渐消失，不需要特殊治疗。
2、内分泌紊乱
可能是血液紧张或者家长施加压力过大，导致内分泌紊乱。有可能出现经期延长或缩短等现象。建议多外出活动，放松身心。
3、子宫功能性出血
由于创伤、神经内分泌调节功能不全等因素可能造成子宫功能性出血，还会伴随白带增多、腹痛、情绪波动较大等异常现象。建议在医生指导下通过黄体酮软胶囊、地屈孕酮片等药物进行治疗。
除此之外，还可能是盆腔炎、子宫内膜异位症等导致，建议及时就医。