跑步心脏刺痛过一会就没事了多考虑生理因素引起的，也有可能是高血压、冠状动脉粥样硬化性心脏病等原因导致的。建议到医院查明原因，根据原因对症治疗。
1、生理因素
如果在日常生活中缺乏体育锻炼，长时间跑步可能会使心脏出现短暂的缺血现象，从而引起一过性的疼痛感。一般不需要进行特殊治疗，可以通过加强体育锻炼的方式进行改善，但是一定要做到循序渐进。
2、高血压
流动血液对血管壁的压力持续高于正常引起的，与大量进食脂肪含量过高的食物、遗传等有一定关系。发病以后会出现头痛、心律失常、心悸等比较典型的症状。可在医生的指导下，使用硝苯地平缓释片、氢氯噻嗪片等药物进行降压治疗，也需要通过清淡饮食的方式进行改善，控制脂肪和盐的摄入量。
3、冠状动脉粥样硬化性心脏病
胆固醇大量沉积在冠状动脉壁上，容易使管腔变得狭窄，从而影响心脏供血出现心绞痛的现象。需要及时遵医嘱使用速效救心丸、硝酸异山梨酯片等药物进行治疗。也可以遵医嘱使用阿司匹林肠溶片、硫酸氢氯吡格雷片等药物防止血栓形成。
另外，不排除与急性心肌梗死有关系。为了避免造成更严重的后果，建议及时到医院就诊治疗。