根部一般是指阴部。男人阴部起水泡多考虑是生殖器疱疹导致的，也可能是阴囊湿疹、龟头炎等原因导致。建议根据不同的原因选择不同的治疗。
1、生殖器疱疹
由于单纯疱疹病毒感染引起的疾病。可以通过性接触传播、母婴传播等方式感染从而出现上述症状。并且伴随着局部烧灼感、瘙痒等症状。建议患者可以在医生的指导下使用阿昔洛韦乳膏、盐酸伐昔洛韦胶囊等药物进行治疗，也可以使用炉甘石洗剂清洗局部。
2、阴囊湿疹
长期处于潮湿的环境中、精神压力过大等因素导致阴囊发生湿疹引起。可能会出现局部丘疹、小水疱等。可以在医生的指导下使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等。也要注意局部的清洁和护理。
3、龟头炎
该疾病是指阴茎包皮和阴茎发生的炎症反应，可能与病原体感染、外伤等因素有关。可能会出现局部红肿、疼痛、溃疡等症状。建议在医生指导下使用克霉唑乳膏、倍他米松乳膏等药物治疗。如果情况严重的患者，可以通过包皮环切术进行治疗。
除此之外，还可能是尖锐湿疣等原因导致的。建议及时去医院就医，明确疾病，对症治疗。