通常情况下，皮下注射和肌肉注射选取的部位有所差异，皮下注射常用的部位一般在上臂与股外侧，而肌肉注射部位一般选择肌肉较丰厚，与大血管、神经距离相对较远的部位。
皮下注射是指将液体药物注射到皮下组织中的方法。一般是主要用于疫苗注射以及一些不能或不应该口服的药物。通常情况下是选择上臂与股外侧进行注射的。该注射方式主要目的是迅速达到药效，进而起到治疗的作用。
肌肉注射的注射部位一般为上臂三角肌、臀大肌、臀中肌和臀小肌等。一般对于不宜采用口服或静脉注射的药物，并且要求比皮下注射更迅速产生疗效时，一般可以采用肌肉注射。此处血管与神经分布较少，脂肪组织较为薄弱，进行肌肉注射时不易引起刺激性肌肉抽搐。
此外，建议患者注意保持注射部位的清洁与卫生，如有不适症状，应该及时就医，避免耽误治疗。