40岁查出心脏有个小洞多考虑是房间隔缺损引起的，也可能是室间隔缺损、动脉导管未闭等疾病引起的，建议患者根据引起的原因对症治疗。
1、房间隔缺损
可能是家族遗传引起的，患者会出现身体乏力、活动后气促的情况。患者可去正规医院通过房间隔缺损修补术、房间隔缺损封堵术等方式进行治疗。
2、室间隔缺损
如果妊娠期间经常服用致畸药物，可能会导致胎儿出现室间隔缺损。患者一般不会出现明显的不适症状，通常在心脏彩超检查时被发现。如果缺损较小，可以不用过于担心，也不需要特殊治疗；如果缺损比较大，患者出现了明显不适，可以通过室间隔缺损封堵术治疗。
3、动脉导管未闭
如果家族中有人患有先天性心脏病，可能会加大患病的概率。患者会出现呼吸急促、嘴唇皮肤发绀、反复咳嗽等情况。患者可遵医嘱口服布洛芬缓释胶囊、头孢克肟分散片等药物进行改善，也可以采取动脉导管未闭封堵术进行治疗。
除此之外，也可能是室间隔穿孔等疾病导致的，建议患者及时就医治疗。