巧克力囊肿一般可以过夫妻生活，但如果巧克力囊肿较大，此时不能进行夫妻生活。
巧克力囊肿大多是由于免疫功能异常、环境因素、遗传等原因所引起，在患病后，卵巢囊肿液体会慢慢形成巧克力样的液体，并伴随痛经、月经失调、不孕等情况。同房时女性体内荷尔蒙发生改变，对舒缓疼痛有一定的帮助，并且同房后如果怀孕，可以抑制异位细胞的生长繁殖。所以巧克力囊肿可以适当进行同房，但要注意不要过度激烈，避免引起囊肿破裂。需要注意，如果囊肿较大，在进行同房时会出现性交痛等不适症状，此类患者不建议同房。
在患病后，要积极到正规的医院进行就诊，在医生指导下采取规范的治疗，可以在医生指导下服用醋酸甲地孕酮分散片、地屈孕酮片、黄体酮软胶囊等药物进行治疗，或者直接进行手术切除。同时，在日常生活中患者要注意个人卫生，做好保暖工作，及时添减衣物，定期进行复查。