肛门间质瘤可能是良性的肿瘤，也可能是恶性的肿瘤，具体是什么性质的还需要做进一步的检查。
肛门间质瘤通常分为良性和恶性两种，需要进行穿刺活检才能确定其性质。肛门间质瘤如果一旦发生，要到医院进行穿刺活检或CT扫描，以明确疾病的性质。如果是良性的间质瘤，可以通过外科手术方法切除，从而得到彻底地治愈。治疗之后对于生活的影响也很小，所以一定要尽早发现尽早治疗。恶性间质瘤对人体的伤害是非常大的，会导致疾病的加重，甚至会顺着淋巴和血液进行转移，一般在术后需要进行放疗、化疗抑制癌细胞生长。
如果发现肛门间质瘤，患者需及时就医，以免贻误病情。