益生菌通常应在饭前约30分钟吃，这样才不会对其药效造成影响。
益生菌具有调理肠道菌群的作用，在服用后可以有效的维持肠道内正常菌群的结构平衡，并促进肠道对食物的吸收和消化。而在吃益生菌时应选择在饭前30分钟服用，因为在刚吃完益生菌后，如果随即吃饭，会导致食物和益生菌混合，从而影响到药物疗效。
而在饭前30分钟吃益生菌，可更有利于身体对药物的吸收，从而促进胃肠蠕动，加快对食物的分解和消化。在服用益生菌时应选择40°左右的温开水送服，以免导致益生菌活性降低。
在服用益生菌药物时，需要遵照医嘱按照剂量服用，避免私自盲目用药。