木薯生吃通常是有毒的，要在处理之后进行食用。
木薯的茎、叶、根中含有氰苷这一种有毒物质，与水结合会产生游离的氢氰酸，氢氰酸分解出的氰根是一种剧毒物质，可以使人体内组织细胞丧失传递氧的能力，导致细胞缺氧诱发出中毒的表现。患者直接食用生的或处理不规范的木薯后，会出现木薯中毒的情况，可表现为呕吐、腹泻、恶心等，严重时可能会出现休克、意识障碍等症状。
木薯在充分浸泡或煮熟后可以食用，吃新鲜木薯时一定去皮，用清水浸泡薯肉，一般需要浸泡6～7天，使木薯中的有毒物质溶解。在食用时需注意木薯是否完全煮熟。木薯中含有丰富的淀粉和蛋白质，具有很高的营养价值，还有消肿的作用。木薯中含有一些膳食纤维，可以促进肠道蠕动，应适当食用木薯，但要避免吃多增加胃肠道负担，应保持饮食营养均衡。