小腿中间骨头上有个凸起，摸着疼可能是血栓性静脉炎、软骨瘤、骨折畸形等原因引起，需要根据病症治疗。
1、血栓性静脉炎
下肢静脉曲张可能会引起血凝块，长期血凝块不易消散会形成硬结，可能会导致中间骨头上有凸起物，可以通过穿弹力袜的方式进行治疗，必要时需要在医生指导下进行外科手术切除栓塞部位。
2、软骨瘤
胚胎发育不良、遗传因素、慢性感染等原因可能会引起软骨瘤，导致骨质之间形成凸起，一般以良性居多。如果软骨瘤体积比较小可定期观察，不做手术，体积较大可采取病灶刮除植骨术、股骨远端骨软骨瘤切除术等手术治疗。若软骨瘤发生恶变，可在医生的安排下，根据病情制定相应的放疗、化疗方案。
3、骨折畸形
小腿部位发生骨折后愈合不良可能会引起骨折畸形，可能会伴随着局部凸起疼痛，可通过外固定治疗、手术内固定治疗等方法，也可遵医嘱通过截骨术、矫形术等手术方式治疗。
除此之外，也不排除是骨肉瘤，建议前往医院进行明确检查。