打完九价HPV疫苗月经不规律可能与情绪不稳定有关，也有可能是内分泌紊乱、子宫内膜异位症等原因引起的，需要根据病因采取针对性的治疗措施。
1、情绪不稳定
注射完疫苗之后，不合理控制自身的情绪，可能会出现情绪波动较大的情况，通常会伴随心慌心悸、心跳加快等症状。此时需要学会调整自身的情绪，不要给自己太大的心理负担。
2、内分泌紊乱
体内的激素水平变化较大，容易导致月经周期发生改变。可以在医生的指导下，合理使用黄体酮胶囊、戊酸雌二醇片等药物进行调理，必要时可针对病因进行手术治疗。
3、子宫内膜异位症
考虑跟子宫内膜的生长部位发生改变有关，容易影响正常的生理规律，还有可能会导致月经量增多，甚至会伴随明显的疼痛症状。可以在医生的指导下，合理使用复方醋酸环丙孕酮片、炔雌醇环丙孕酮片等药物进行治疗，从而使疾病得到缓解，必要时也可以进行宫腔镜手术。
除此之外，还有可能跟子宫肌瘤等原因有关，需要及时就诊。