男性右侧肾部隐隐疼痛很可能是肾结石引起的，但也不排除是输尿管结石、急性肾盂肾炎等疾病导致的，患者需要尽早去医院进行检查对症治疗。
1、肾结石
患者患有肾结石可能是机体代谢异常等原因导致尿液中的可溶物浓度过高，进而形成结晶沉积在肾脏诱发结石的情况，在临床通常会出现疼痛等症状，建议在医生的指导下服用肾石通颗粒等药物进行缓解，必要时通过体外冲击波碎石、经皮肾镜等方式进行治疗。
2、输尿管结石
输尿管结石可能是肾脏结石排出时在输尿管处嵌顿导致的，进而会出现腰部疼痛，伴随排尿困难、血尿等症状，建议在医生的指导下通过输尿管硬镜碎石取石术等手术的方式进行治疗，同时要做好术后的护理。
3、急性肾盂肾炎
急性肾盂肾炎可能是尿路感染出现上行感染等原因引起的，进而会出现细菌侵犯肾脏组织出现急性化脓性炎症的情况，常见的症状有腰部疼痛等，伴有高热、血尿等症状。建议在医生的指导下服用头孢拉定分散片、阿莫西林胶囊等消炎的药物。
除了上述原因以外，还可能是患有肾囊肿等疾病导致的，建议及早治疗，有利于减轻疾病对身体的影响。