双肾尿盐结晶是否会自愈需要根据具体病因分析。
如果平时是不良的饮食习惯和生活习惯等原因所引起双肾尿盐结晶，通过改变饮食习惯和生活习惯，如多休息、保证睡眠、饮食注意清淡等，此时则有可能会自愈。但如果是由于疾病原因所引起，例如长期吃高嘌呤的食物，引起高尿酸血症，甚至造成痛风，此情况则不能治愈，需要口服降嘌呤，促进尿酸排泄类的药物进行控制，才能治愈。此外如果是原发性疾病，例如输尿管炎、肾小球肾炎等疾病，导致尿液成分异常，形成尿盐结晶，此情况也无法自愈，只有彻底治愈原发性疾病之后，双肾尿盐结晶才能得到缓解。
在治疗过程当中要调整饮食习惯和生活习惯，饮食注意规律，不要暴饮暴食，适当进行锻炼，增强机体免疫力，遵医嘱按时服用药物，定期复查。