五联益生菌一般不可以长期吃，长期吃比较容易破坏体内肠道菌群的平衡。
五联益生菌属于临床常用的一种调节肠道菌群药物，主要是由乳杆菌、双歧杆菌、酵母菌、益生芽孢菌、丁酸菌等组成的，患者一般可在医生的指导下适量服用来调节肠道，增加食物的分解和消化，减轻消化不良导致的不适。若长期服用五联益生菌可能会破坏肠道原有的菌群，导致菌群紊乱，部分人群还可能产生耐药性，不利于保持消化系统正常的生理功能，进而影响到身体健康。
建议日常生活中要合理使用益生菌类药物，如果相关症状长时间得不到缓解，则需要及时停药，并及时去医院就医，进行其它对症的治疗。