南瓜里面长芽了是否能吃，需要判断南瓜是否变质决定，通常可以分为能吃和不能吃 。
1、能吃
南瓜内部种子发芽说明南瓜已经成熟比较久的时间，如果存放南瓜地方温度、湿度适宜，南瓜没有进入生理休眠，就会导致南瓜出现发芽现象，属于正常的生理现象。只要南瓜表皮和果肉没有出现腐烂，就可以正常食用，但种子发芽需要消耗南瓜的营养成分，所以此时的南瓜营养价值可能会有所降低，口感也会有所降低。
2、不能吃
如果南瓜出现变质，则不适合继续食用，此时的南瓜已经被细菌污染，产生大量的有毒物质，如果继续食用可能会引起胃肠炎、食物中毒等情况，主要表现为腹痛、腹泻、呕吐等症状。如果南瓜发芽地方比较多或者发芽后南瓜不新鲜，并且难以判断是否腐烂，则不建议再吃南瓜，可以选择新鲜的南瓜食用，以免造成严重后果，如果误食变质的南瓜还需要及时就医，完善相关检查后再进行下一步治疗，以免加重病情。