苄索氯铵大多常用在日常消毒类用品。
苄索氯铵用于杀菌消毒剂，具有较好的表面活性，广泛用于日化医疗等领域，做防腐、杀菌剂，例如消毒纸巾、消毒洗手液等，主要适用范围在手部、皮肤表面消毒。苄索氯铵极易溶于水，有非常强的刺激性，不能用于口腔卫生一类的漱口产品和驻留产品。如果使用不当或浓度过高，对皮肤会产生一定的刺激性，导致出现疼痛、瘙痒、蜕皮等过敏症状。此外此类物质也可以作为防腐剂，如果不慎接触眼睛对眼结膜也会产生一定的刺激性。
在使用含有苄索氯铵物品时，注意观察自身相关情况，尽量到正规合规的生产厂家进行购买，如果不小心接触出现不适症状，建议及时就医，以免延误治疗。