布拉氏酵母菌散的使用禁忌主要体现在禁忌人群、饮食、用药等方面，建议患者遵医嘱用药，不可盲目服用，以免对身体造成不利影响。
1、禁忌人群
布拉氏酵母菌散属于活菌制剂，含有一定果糖和乳糖，可以用于改善胃肠道菌群紊乱等现象。果糖、乳糖不耐受及半乳糖吸收障碍综合征等人群禁用，对其中某一成分有过敏倾向时不可使用。除此之外，如果正处于中央静脉导管治疗过程中，也不建议服用。
2、饮食
该药物内含有活细胞，不建议和过高温度的热水、冰冻的水或含有酒精的饮品、食物同时使用。另外，用药过程中要避免摄入过多辛辣刺激性食物，比如辣椒、大蒜等，也要避免吃发物，比如鱼、虾等。以免影响药效。
3、用药
服用该药物期间要避免与抗菌药物一起服用，比如头孢类抗菌药、青霉素类抗菌药等，也要避免与抗酸药物一起用，以免影响到药物疗效。
此外，孕妇或哺乳期女性应尽量避免使用该药物。用药过程中要多注意卧床休息，多喝水，多排尿，能更好促进身体吸收药物并恢复。