肛门肿了个小疙瘩要根据不同的原因选择合适的治疗方式，可能是痔、毛囊炎、肛周脓肿、肛瘘等原因引起的。
1、痔
痔是由于肛管或直肠下端的静脉充血肿大所导致的一种疾病，通常与长期便秘、久坐等因素有关。如果患者的病情比较轻微，并没有出现明显的不适症状，可以通过温水坐浴的方式进行缓解，必要时，患者也可以在医生指导下使用复方角菜酸酯乳膏、熊胆痔疮膏等药物进行治疗。
2、毛囊炎
如果不注意个人卫生，导致细菌感染，会出现红色丘疹，并且还会有白色脓疱以及瘙痒感等症状。可遵医嘱外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗。
3、尖锐湿疣
尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染所致的以肛门生殖器部位增生性损害为主要表现的性传播疾病。建议患者可以在医生指导下使用鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏等外用涂抹患处进行治疗。对于体积较大的疣体，患者则可以遵医嘱通过液氮冷冻、激光等方式进行物理治疗。
4、肛周脓肿
肛周脓肿通常是由于细菌感染所引起的一种疾病，会导致局部出现红肿疼痛的情况发生。患者可配合医生通过高锰酸钾溶液坐浴的方式进行治疗，从而达到消炎杀菌的效果。必要时，患者还需要及时就医，在医生的操作下行切开引流术进行治疗。
5、肛瘘
肛瘘是肛管或直肠周围的肉芽肿性管道，由内口、外口和管道三部分组成。肛瘘多为肛门脓肿破溃或切开引流后所形成，常有反复发作的流脓史。若不积极治疗，可形成高位复杂性肛瘘。肛瘘一旦确诊，应尽早手术治疗，因为肛瘘反复发作将严重影响生活质量。
在排完便之后患者要及时使用温水清洗局部位置，并且还要勤换洗内裤，预防出现感染情况。建议患者及时医院的肛肠外科就医进行检查，明确具体的原因后对症治疗。