不存在眼疲劳疼痛用什么眼药水最好这种说法。眼疲劳疼痛多数是过度用眼所引起的，但不排除是细菌感染、病毒感染等原因导致的，此时可以使用缓解眼疲劳的眼药水、消炎杀菌的眼药水、抗病毒的眼药水等药物进行治疗，有助于疾病好转。
1、过度用眼
如果在平时长时间熬夜，严重睡眠不足，可能会使眼睛过于疲劳，甚至还会伴有隐隐作痛的情况。此时可以遵医嘱，配合使用缓解眼疲劳的滴眼液进行治疗，比如玻璃酸钠滴眼液、羧甲基纤维素钠滴眼液等，通常具有一定的作用。
2、细菌感染
如果眼睛部位受到细菌感染，可能会出现眼睛分泌物增多的情况，也可能会出现眼睛疼痛、瘙痒等情况，此时可以遵医嘱使用消炎杀菌的眼药水进行处理，比如盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等。
3、病毒感染
如果眼睛受到病毒的感染以后，可能会出现眼睛刺痛、流眼泪等情况，甚至会伴有容易疲劳的现象。此时可以遵医嘱使用抗病毒的眼药水进行治疗，比如阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液等。
另外，也可能与过敏等原因有关系，需要及时去医院进行检查，然后再进行治疗。