临床上不存在胃肠溃疡吃什么药最好的说法。胃肠溃疡临床上一般使用抑制胃酸分泌药物、保护胃黏膜药物、根除幽门螺杆菌药物等药物来治疗。胃肠溃疡引起原因常见由化学因素，长期饮用酒精或长期服用药物易致此病发生。
1、抑制胃酸分泌药物
抑制胃酸分泌的药物有质子泵抑制剂如奥美拉唑、雷贝拉唑、兰索拉唑、艾普拉唑等；H2受体阻滞剂如西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁等。应用药物抑制胃酸分泌，目的在于缓解疼痛，促进溃疡愈合，防止并发症。
2、保护胃黏膜药物
保护胃黏膜药物目的是中和胃酸，起效较快，可短暂缓解疼痛。常用药物有铋剂为枸橼酸铋钾；弱碱性抗酸剂常用有铝碳酸镁、硫糖铝、氢氧化铝凝胶等。
3、根除幽门螺杆菌药物
治疗幽门螺杆菌的药物包括抗生素、铋剂以及质子泵抑制剂等，如克拉霉素、阿莫西林、果胶铋、奥美拉唑。这些药物过敏者禁用，在遵医嘱按照疗程规范服用药物后，遵医嘱停药后再进行碳13或者碳14呼气试验，从而判断有无根治成功。
如果患者患有胃肠溃疡，要及时到医院进行治疗，在医嘱下服用一些药物，不可以自行购买服用。