吃完紧急避孕药月经12天还不干净，一般是避孕药的药物成分刺激造成的，但也不排除是子宫息肉、宫颈炎等疾病引起的，建议患者根据具体的原因遵医嘱进行针对性治疗。
1、药物成分刺激
紧急避孕药中含有一定的孕激素成分，对于卵巢分泌激素以及卵子排出等基本功能会产生一定的影响，推迟卵子排出的时间，达到避孕的目的。使用避孕药物后会对卵巢激素分泌功能产生影响，可能会造成激素分泌紊乱，导致月经12天后还不干净、月经血量较多等症状。若是药物成分刺激造成的，患者可以通过清淡饮食、规律作息等方法调整自己的状态，改善不适的症状。
2、子宫息肉
子宫内膜细胞组织受到自身激素分泌的影响，可能会对子宫内膜细胞组织正常增生的频率产生刺激，诱发子宫息肉，造成月经淋漓不尽、月经血量较多等症状。此时患者可以遵医嘱通过子宫内膜息肉切除术等方法来控制以上疾病的发展。
3、宫颈炎
女性患有宫颈炎疾病后，宫颈部位细胞组织会受到炎症刺激，影响宫颈细胞的正常生理活动，出现宫颈细胞组织破损，引起月经时间过长、月经血量增多、小腹胀痛等不适的症状。患者出现宫颈炎时，可以遵医嘱使用头孢克肟分散片、头孢拉定胶囊等药物来治疗。
除此之外，也有可能与子宫腺肌症等疾病有关，建议根据具体的病因选择适当的方法来改善或遵医嘱接受规范的治疗。