睡醒胃疼可能是生理性因素引起，也可能是胃炎或者是胃溃疡导致，应针对不同病因，采取不同的处理措施。
1、生理性因素
患者可能是由于腹部受凉、饥饿等生理性因素引起的，这种情况下不需要特殊处理，可以用热水袋热敷腹部，多喝热水，适当食用清淡易消化的食物，症状会逐渐缓解。
2、胃炎
当炎症刺激胃黏膜，造成胃黏膜充血水肿，从而引起睡醒胃疼，还会伴有腹泻、恶心、呕吐等现象。主要以药物治疗为主，有雷尼替丁、法莫替丁、奥美拉唑、泮托拉唑等药物，服药需在医生指导下进行。患者平时应多吃一些营养丰富的清淡食物和含维生素多的新鲜瓜果蔬菜。不要吃油腻、生冷、辛辣的食物。
3、胃溃疡
胃溃疡患者由于晚上胃酸分泌会相应地增多，从而导致睡醒胃疼的现象出现，同时还可伴有恶心、嗳气、烧心、吐酸水等症状。主要以药物治疗为主，如奥美拉唑，泮托拉唑或雷贝拉唑等，用药需要遵医嘱进行。治疗期间还应戒烟、戒酒及少饮浓茶、浓咖啡。
除上述原因外，还有可能是十二指肠溃疡等疾病所致。建议及时就医，查明病因，尽早治疗。