拉肚子称为腹泻，通常情况下，若服用阿莫西林胶囊不当可能会引起腹泻的不良反应。
阿莫西林胶囊是一种青霉素类的抗生素，服用后会引起恶心、呕吐、腹泻、腹痛等肠胃道的不适，严重的还会引起假膜性肠炎、胃溃疡等疾病，对青霉素类、青霉素皮肤试验为阳性者，最好不要使用。阿莫西林胶囊的副作用主要有恶心、呕吐、腹泻、假膜性肠炎等胃肠反应，长期服用会导致贫血、血小板减少、转氨酶升高、念珠菌或耐药细菌引起的二次感染等。出现兴奋、焦虑等中枢神经系统的表现，还会出现皮疹、哮喘等过敏反应。
口服或注射所有青霉素类药物之前，必须先做皮试，切勿疏忽。对阿莫西林过敏或对青霉素产生过敏反应的人群需要避免服用。用药过程中如果出现不良反应，要及时停药，以免症状加重。如果需要服用阿莫西林胶囊，请结合自身情况在专业医生指导下用药。