头疼查不出来原因多考虑是不良的生活习惯引起的，还可能是偏头痛、紧张性头痛等原因导致的，具体的情况还需要去医院的神经内科进行检查。
1、不良的生活习惯
在平时如果长期熬夜、作息不规律、长期焦虑紧张可能会导致机体过度劳累，进而对神经和血管造成影响，常见的症状会出现头晕、全身乏力等，一般改掉不良的生活习惯即可，不属于器质性病变，所以是查不出来的。
2、偏头痛
偏头痛一般表现为反复发作的一侧搏动性头痛，可能会出现恶心、呕吐，少数典型的患者发病前可能会出现视觉、感觉或者运动功能障碍等先兆。若疼痛不止，建议及时就医，可在医生的指导下服用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等药物缓解。
3、紧张性头痛
紧张性头痛主要是机体过于劳累、睡眠质量差等不良的生活习惯引起的，还可能与精神疾病有关，一般是不会出现器质性改变的，所以检查是无法查出的，可通过日常调节作息和饮食规律，保持良好心情进行缓解，必要时可遵医嘱使用酮洛芬、萘普生等药物进行治疗。
除了上述原因以外，还可能与丛集性头痛等原因有关，建议及时前往医院进行就医治疗，并定时复查。