良性癫痫综合征青春期是否能自愈，需要根据病情的严重程度进行判断。
1、能自愈
该疾病是儿童期常见的一类良性疾病，第一次发作时间一般在3岁-14岁，其中6岁-10岁最为常见，一般在睡眠中经常发作，并且在入睡后半小时到一小时内发作较多。大部分患者随着年龄的增长以及青春期的到来，临床发作和脑电图异常都会随之消失。
2、不能自愈
青春期若良性癫痫综合征发作，通常会出现口角向一侧歪斜、肢体抽搐、发音不清等症状，部分严重患者甚至会出现全身抽搐的情况，甚至会导致神经细胞坏死，影响患儿的大脑正常发育。这种情况一般是比较严重的，可能无法自愈。出现这种情况，建议及时到正规医院进行相关检查，并在医生的指导下使用丙戊酸钠片、拉莫三嗪片等药物进行治疗。