体温39.6度多考虑会导致电解质紊乱，也可能会导致胃肠功能紊乱、惊厥等危害，建议根据不同的疾病选择不同的治疗。
1、电解质紊乱
电解质紊乱是指人体内电解质不平衡的一种状态，当人体温度太高的情况下，会导致机体产生的热量增加，水分流失过多，从而引起的疾病，可能会出现口渴、腹泻等症状。建议在医生指导下口服补液盐、静滴葡萄酸钙、氯化钾等来治疗。
2、胃肠功能紊乱
胃肠功能紊乱是由生理、心理、社会因素等相互作用所致的疾病，当患者出现高热的时候，会导致体内消化液分泌减少从而引起胃肠功能紊乱，一般会出现腹痛、腹泻、便秘等症状。建议患者可以在医生的指导下使用多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等药物进行治疗，也需要注意多喝水。
3、惊厥
惊厥是脑细胞异常放电导致全身和局部肌肉抽搐，当患者出现高热的时候，会导致脑细胞缺氧，神经系统兴奋性增加，从而会引起惊厥，一般会出现抽搐、口唇发紫等症状。建议患者可以在医生的指导下使用对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗，也可以通过颅内肿物切除手术进行治疗。
除此之外还可能导致呼吸衰竭、心力衰竭等疾病的危害，如果出现高热的情况，及时去医院就医，避免延误病情。