通常情况下，低温灭菌主要适用于关节镜、膀胱镜、血透析仪等器械。
经常使用的医疗器械，主要包括高温灭菌和低温灭菌。而高温灭菌主要是利用压力蒸汽，将部分器械进行高温消毒，从而达到杀菌的目的。而低温灭菌主要是利用甲醛蒸汽灭菌法或者是环氧乙烷灭菌法的方式进行消毒处理，比较适用于无法耐高温的器械，比如关节镜、膀胱镜、血透析仪等。如果上述器械经过高温的方式进行灭菌，可能会使仪器受到破坏，而且灭菌效果并不是很好。
当器械灭菌以后，还要避免用手直接接触，否则会使手部的细菌或者是病菌附着在器械表面，从而增加手术感染的几率。而且在手术过程中，要保持室内环境的清洁，也要尽量在无菌的环境中进行操作。