脸上透明凸起小疙瘩可能是痤疮、过敏性皮炎、单纯疱疹引起的，需要根据不同的原因选择合适的治疗措施。
1、痤疮
痤疮通常是由体内激素水平变化引起的，可能会导致毛囊皮脂腺的功能出现角化异常，体内的分泌物难以排出，进而导致面部出现透明脓包。建议在日常生活中注意调整饮食以及生活状态，养成良好的生活习惯，注意脸部的清洁，帮助缓解不适的症状。痤疮比较严重时患者也可以遵医嘱使用阿达帕林凝胶、维A酸乳膏等药物来缓解。
2、过敏性皮炎
过敏性皮炎通常是由接触致敏原引起的，可能会导致局部皮肤出现超敏反应，进而导致面部出现水疱、丘疹，并伴有剧烈瘙痒的症状。患者可以遵医嘱涂抹丁酸氢化可的松乳膏、地奈德乳膏等药物来缓解，如果外用药物的治疗效果不佳，也可以遵医嘱口服盐酸左西替利嗪片、氯雷他定片等药物来治疗。
3、单纯疱疹
单纯疱疹是由感染单纯疱疹病毒导致的，单纯疱疹病毒可能会侵袭皮肤黏膜交界处，造成局部出现簇集性透明小水疱，并伴有疼痛、发热等不良症状。患者可以在医生的指导下外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等抗生素药物来治疗，同时遵医嘱口服阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等抗病毒药物来缓解。
脸上透明凸起小疙瘩还可能是增殖型天疱疮引起的，建议患者及时去医院就诊，查明原因后遵医嘱进行相应的治疗，以免贻误病情。